พื้นที่อำเภอหนองโดน จำนวน 88.07 ตร.กม. (55,093.75 ไร่)
อำเภอหนองโดน มี 4 ตำบล 34 หมู่บ้าน
– ต.หนองโดน มี 11 หมู่บ้าน
– ต.บ้านกลับ มี 10 หมู่บ้าน
– ต.บ้านโปร่ง มี 5 หมู่บ้าน
– ต.ดอนทอง มี 8 หมู่บ้าน
ลักษณะพื้นที่เป็นที่ราบลุ่ม ลาดเอียงจากทิศตะวันออก มาทิศตะวันตก มีคลองชลประทานชัยนาทป่าสัก ตัดผ่านด้านทิศตะวันตกของอำเภอในด่านตะวันตกของคลองชลประทาน
